研究发现一种小型RNA依赖于个人属性

我们体内的细胞是成千上万被称为rna的微小分子的家园。有许多不同类型的rna——有些携带特定蛋白质的编码,有些携带堆栈内的东西,有些可能影响基因的开启/关闭。新的rna及其功能仍在被发现。托马斯·杰斐逊(Thomas Jefferson)计算医学中心伊西多罗·里古索斯(Isidoro Rigoutsos)博士实验室的研究人员描述了已知的少量RNA的新特性,称其为“核糖体RNA衍生物片段”或rRFs。

研究人员分析了大约450名健康个体的样本,这些个体参与了1000个基因组计划,这是一项国际努力,目的是对人类种群中的基因变异进行分类。这些样本来自世界各地5个不同的人群。分析集中在一组大约5万个核糖体RNA (rRNA)分子上。这些rRNA-衍生物片段最初可能是废物和降解的副产品。

事实上,我们发现这种大型的短调控rna是以一种有组织的方式产生的。

TESS Cherlin博士的候选人,该研究的第一作者

在发现的数千种rRFs中,有许多存在于所有样本中。然而,相当多的rRFs似乎取决于个人的某些属性。苔丝说:“我们发现这种类型的RNA的存在在很大程度上受到这个人是男性还是女性,或者他的种群起源的影响。”

“找到并完成rRFs的数量给了我们喘息的机会。多年来,该领域假设相同的短dna片段,也就是RNA的起始物质,将在所有人身上产生相同的短RNA。我们在过去近十年的工作表明,这是不可能的。“最初,我们发现isomiRs的丰度,microrna的亚型,取决于个人属性。所以我们发现同样的依赖性也存在于tRFs的丰度中,即从转移RNA中提取的短片段。现在,我们发现rRFs也是如此。

这在疾病易感性的背景下是很重要的;许多疾病对人们的影响不同于某些蛋白质的丰度,高的或低的。有越来越多的证据表明,rRFs可以像异麦蛋白和tRFs一样,调节一堆蛋白质的产量。在某些疾病中,这种调节控制可能会改变,蛋白质制造过多或过少。因此,对于科学家来说,了解这些短rna的正常水平是非常重要的,以便了解它们是如何被疾病改变的。这项新研究表明,这些正常水平在性别或出身人群中是不同的。

Rigoutsos博士说:“现在就知道rRFs在作用机制上与microrna相似还为时过早。”“但它们的识别是理解rRFs如何增加我们基因谱复杂性的一个非常重要的第一步,对于未来的预测疾病和设计定制疗法可能很重要。”

这项研究发表在《BMC生物学》上。

托马斯杰弗逊大学

Cherlin, T., et al.(2020)将核糖体RNA裂解为短RNA (rRFs),并以性别和群体特异性的方式进行调控。BMC生物学。doi.org/10.1186/s12915 - 020 - 0763 - 0。

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